標題: Titlebook: Optimization in Computational Chemistry and Molecular Biology; Local and Global App C. A. Floudas,P. M. Pardalos Book 2000 Springer Science [打印本頁] 作者: Lensometer 時間: 2025-3-21 17:59
書目名稱Optimization in Computational Chemistry and Molecular Biology影響因子(影響力)
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作者: Meander 時間: 2025-3-21 21:11 作者: 沒花的是打擾 時間: 2025-3-22 02:57
Optimization of Carbon and Silicon Cluster Geometry for Tersoff Potential using Differential Evoluth. The algorithm is tested on hard practical problems from computational chemistry. These are the problems of semi-empirical many-body potential energy functions considered for carbon-carbon and silicon-silicon atomic interactions. The minimum binding energies of both carbon and silicon clusters consisting of upto 15 particles are reported.作者: avarice 時間: 2025-3-22 05:32 作者: 牌帶來 時間: 2025-3-22 08:53 作者: 咯咯笑 時間: 2025-3-22 16:20 作者: Commentary 時間: 2025-3-22 18:27 作者: 煞費苦心 時間: 2025-3-22 21:55 作者: 搖曳 時間: 2025-3-23 05:28 作者: 倔強不能 時間: 2025-3-23 08:47 作者: 改革運動 時間: 2025-3-23 10:52
D.C. Programming Approach for Large-Scale Molecular Optimization via the General Distance Geometry lve the original problem by applying DCA from the point obtained by Phase 1. Requiring only matrix-vector products and one Cholesky factorization, DCA seems to be robust and efficient in the large scale setting as proved by numerical simulations which furthermore indicated that DCA always converges to global solutions.作者: fructose 時間: 2025-3-23 15:34
1571-568X niques for addressing severalcomputational chemistry and biology problems. A tantalizing problemthat cuts across the fields of computational chemistry, biology,medicine, engineering and applied mathematics is how proteins fold.Global and local optimization provide a systematic framework ofconformati作者: PAD416 時間: 2025-3-23 21:03 作者: olfction 時間: 2025-3-23 23:46 作者: 襲擊 時間: 2025-3-24 04:10
Energy Landscape Projections of Molecular Potential Functions,ntial surfaces with very large numbers of local minima. This paper shows how statistics provided by the CGU global optimization algorithm can be used to characterize and interpret these topographies using a 2-dimensional landscape projection.作者: 暫時休息 時間: 2025-3-24 07:09
Protein Folding Simulations by Monte Carlo Simulated Annealing and Multicanonical Algorithm, oligopeptides, C-peptide of ribonuclease A and the fragment BPTI(16–36) of bovine pancreatic trypsin inhibitor. The lowest-energy conformations obtained have .-helix structure and .-sheet structure for C-peptide and BPTI(16–36), respectively, in accord with experimental implications.作者: 無意 時間: 2025-3-24 14:28 作者: 大吃大喝 時間: 2025-3-24 15:06
978-1-4419-4826-7Springer Science+Business Media Dordrecht 2000作者: 微生物 時間: 2025-3-24 21:59 作者: 門窗的側柱 時間: 2025-3-25 02:20 作者: 滴注 時間: 2025-3-25 06:15
https://doi.org/10.1007/978-1-4757-3218-4algorithm; algorithms; database; databases; global optimization; linear optimization; local optimization; m作者: Formidable 時間: 2025-3-25 07:59
Julie C. Mitchell,Andrew T. Phillips,J. Ben Rosen,Lynn F. Ten Eyck, so resultieren aus diesen Verh?ltnissen mannigfache eigentümliche einfachere oder compliciertere Ver?nderungen der Form des Sehnerven, z. B. bedeutende Abplattungen des ganzen Nerven mit geringeren oder st?rkeren Einbuchtungen oder mit neben letzteren noch bestehenden Kerbungen und entsprechender 作者: Narrative 時間: 2025-3-25 13:55
William E. Hart,Chris Rosin,Richard K. Belew,Garrett M. Morris, so resultieren aus diesen Verh?ltnissen mannigfache eigentümliche einfachere oder compliciertere Ver?nderungen der Form des Sehnerven, z. B. bedeutende Abplattungen des ganzen Nerven mit geringeren oder st?rkeren Einbuchtungen oder mit neben letzteren noch bestehenden Kerbungen und entsprechender 作者: ROOF 時間: 2025-3-25 15:58
Erik Kangas,Bruce Tidorusgebeuteten Ablagerung untersilurischer Kalkgeschiebe von Sadewitz bei Oels, welche von . selbst, dem ersten Beobachter derselben, übersandt und etikettirt ist; sodann einige von dem verstorbenen Superintendenten E. . bei Eberswalde und Prenzlau gesammelte Stücke. Die Sammlung versteinerungsloser G作者: 帶來 時間: 2025-3-25 21:30
Sheldon Dennis,Carlos J. Camacho,Sandor Vajdausgebeuteten Ablagerung untersilurischer Kalkgeschiebe von Sadewitz bei Oels, welche von . selbst, dem ersten Beobachter derselben, übersandt und etikettirt ist; sodann einige von dem verstorbenen Superintendenten E. . bei Eberswalde und Prenzlau gesammelte Stücke. Die Sammlung versteinerungsloser G作者: 彎曲的人 時間: 2025-3-26 02:10
Andrei B. Bogatyrevdie organischen Einschlüsse unserer Silurgeschiebe, und manches meiner besten Stücke musste dafür mehrfach auseinandergebrochen werden. Bei diesen Studien, deren Ergebnisse nachstehend dargelegt sind, habe ich vorzugsweise auf folgende, in der Literatur-Uebersicht angeführte Specialabhandlungen Bezu作者: Sinus-Rhythm 時間: 2025-3-26 08:08 作者: Gustatory 時間: 2025-3-26 12:06
M. M. Ali,A. T?rnit der Verz?gerung der mittleren Geschwindigkeit c. beim Ausflie?en zu erkl?ren ist. Das Ende der inneren Schaufel steht n?mlich (Tafel V) nicht parallel der Tangente, welche an die ?u?ere Schaufel im Endpunkte gelegt werden kann, sondern es ist nach innen abgebogen, so da? eine Querschnittsvergr??e作者: 博識 時間: 2025-3-26 14:51
Thi Hoai An Le,Dinh Tao Phamit der Verz?gerung der mittleren Geschwindigkeit c. beim Ausflie?en zu erkl?ren ist. Das Ende der inneren Schaufel steht n?mlich (Tafel V) nicht parallel der Tangente, welche an die ?u?ere Schaufel im Endpunkte gelegt werden kann, sondern es ist nach innen abgebogen, so da? eine Querschnittsvergr??e作者: 構成 時間: 2025-3-26 17:58
Structure Calculations of Symmetric Dimers using Molecular Dynamics/Simulated Annealing and NMR Resilable NOEs. Two calculations with variable number of intra-monomer long range NOEs were made to determine what a “reasonably well-defined” monomer is. RIIα consists of two helixloop-helix patterns that form an X-type four helix bundle structural motif. A strong hydrophobic core is observed which co作者: 使長胖 時間: 2025-3-27 00:32 作者: inhumane 時間: 2025-3-27 04:04
Exploring potential solvation sites of proteins by multistart local minimization,ther modified for constrained minimization, called the complex method. Both the simplex and the complex methods are much faster than mapping the free energy surface. The calculations are applied to T4 lysozyme with data available on the conservation of solvent binding sites in 18 crystallographycall作者: 排名真古怪 時間: 2025-3-27 09:11 作者: 思想上升 時間: 2025-3-27 10:45 作者: NUL 時間: 2025-3-27 16:57
Optimization in Computational Chemistry and Molecular BiologyLocal and Global App作者: Seminar 時間: 2025-3-27 20:27
Aqil Azmi,Richard H. Byrd,Elizabeth Eskow,Robert B. Schnabel,Silvia Crivelli,Thomas M. Philip,Teresa作者: Gingivitis 時間: 2025-3-27 23:38
Volker A. Eyrich,Daron M. Standley,Richard A. Friesner作者: 中和 時間: 2025-3-28 05:42 作者: Fecundity 時間: 2025-3-28 06:52
M. G. Ierapetritou,I. P. Androulakis,D. S. Monos,C. A. Floudas作者: Confirm 時間: 2025-3-28 13:10
Julie C. Mitchell,Andrew T. Phillips,J. Ben Rosen,Lynn F. Ten Eyckndern um schwerere Ver?nderungen ?hnlicher Art hei den h?heren Graden der Erkrankung zun?chst der Carotis handelt. Manchmal sind dann weiter neben den dadurch bedingten breiteren und tieferen Einbuchtungen und einer Gesamtabplattung des Nerven oder aber auch allein für sich tief einschneidende Kerbe作者: 常到 時間: 2025-3-28 16:49 作者: OFF 時間: 2025-3-28 22:06
Erik Kangas,Bruce Tidort, und allm?hlich eine Sammlung dieser interessantesten Dokumente des diluvialen Ph?nomens zusammengebracht, welche kaum von einer andern ?hnlicher Art übertroffen werden dürfte. In den .’schen Sammlungen fand ich nur wenig dahin Geh?riges vor, haupts?chlich Handstücke von Granit, Porphyr, Gneiss un作者: 侵略者 時間: 2025-3-29 01:33
Sheldon Dennis,Carlos J. Camacho,Sandor Vajdat, und allm?hlich eine Sammlung dieser interessantesten Dokumente des diluvialen Ph?nomens zusammengebracht, welche kaum von einer andern ?hnlicher Art übertroffen werden dürfte. In den .’schen Sammlungen fand ich nur wenig dahin Geh?riges vor, haupts?chlich Handstücke von Granit, Porphyr, Gneiss un作者: 令人悲傷 時間: 2025-3-29 06:54
Andrei B. Bogatyreve Betrachtungen über die systematische Eintheilung dieser Cephalopoden. Seitdem ist der letztere Gegenstand auch von anderen Seiten behandelt worden, ohne dass dabei ein irgendwie abschliessendes Resultat herausgekommen w?re; dazu kommen Untersuchungen über die inneren Charaktere der betreffenden si作者: languid 時間: 2025-3-29 09:53
Dexuan Xie,Tamar Schlicke Betrachtungen über die systematische Eintheilung dieser Cephalopoden. Seitdem ist der letztere Gegenstand auch von anderen Seiten behandelt worden, ohne dass dabei ein irgendwie abschliessendes Resultat herausgekommen w?re; dazu kommen Untersuchungen über die inneren Charaktere der betreffenden si作者: 熱烈的歡迎 時間: 2025-3-29 14:06 作者: 女上癮 時間: 2025-3-29 15:49 作者: 小步走路 時間: 2025-3-29 22:29 作者: 伙伴 時間: 2025-3-30 00:30
Methodology for Elucidating the Folding Dynamics of Peptides : Met-enkephalin Case Study,wever, this problem may be intractable for realistically modeled systems, such as those represented by all atom force-fields. In this work, a method for mapping the connectivity of relatively low energy regions through the identification of first order transition states is introduced. The methodolog作者: vanquish 時間: 2025-3-30 06:09 作者: 巨頭 時間: 2025-3-30 09:48
Global Optimization and Sampling in the Context of Tertiary Structure Prediction: A Comparison of Tin terms of energy minimization, diversity of the resulting low-energy structures, and energetic rank of native-like structures. Four proteins (PDB codes 1GB1, 1CC5, 1MBD and 1GDM) are studied using each program, with the same target function, allowing a rigorous comparison of performance. In terms 作者: Gleason-score 時間: 2025-3-30 15:54 作者: demote 時間: 2025-3-30 19:11 作者: Indebted 時間: 2025-3-31 00:30 作者: Exposure 時間: 2025-3-31 03:07 作者: chastise 時間: 2025-3-31 08:31
Structure Prediction of Binding Sites of MHC Class II Molecules based on the Crystal of HLA-DRB1 anactivate the immune response. A number of class II histocompatibility molecules have been analyzed by crystallography and include the molecules HLA-DR1 [59], HLA-DR3 [22], and I-.. [21]..A novel theoretical predictive approach is presented that can determine three dimensional structures of the bindi作者: 潛伏期 時間: 2025-3-31 12:41
A Coupled Scanning and Optimization Scheme for Analyzing Molecular Interactions,ipe for the implementation of hybrid algorithms. Hybrid methods create improved algorithms from existing ones by mixing techniques in a way that maximizes advantages and minimizes disadvantages. Here, we outline a hybrid method for molecular docking which couples the rapid-scanning algorithm DOT wit作者: 故意 時間: 2025-3-31 14:05
Improved Evolutionary Hybrids for Flexible Ligand Docking in AutoDock,brid evolutionary algorithms (EAs) incorporate specialized operators that exploit domain-specific features to accelerate an EA’s search. We consider hybrid EAs that use an integrated local search operator to refine individuals within each iteration of the search. We evaluate several factors that imp作者: Decimate 時間: 2025-3-31 19:38
Electrostatic Optimization in Ligand Complementarity and Design,. Using a continuum electrostatic approximation based on the linearized Poisson-Boltzmann equation, the electrostatic free energy of rigid bimolecular association becomes a quadratic function of the reactant-charge distributions. By optimizing the charge distribution of one reactant, we find that th作者: HAIL 時間: 2025-4-1 01:18 作者: 休閑 時間: 2025-4-1 03:38
Visualization of Chemical Databases Using the Singular Value Decomposition and Truncated-Newton Minyses and drug design applications. The compounds in the database are described as vectors in the high-dimensional space of chemical descriptors. The algorithm is based on the singular value decomposition (SVD) combined with a minimization procedure implemented with the efficient truncated-Newton pro作者: 性學院 時間: 2025-4-1 06:48
Optimization of Carbon and Silicon Cluster Geometry for Tersoff Potential using Differential Evolutoration and localization of search, periodically uses topographical information on the objective function, in particular the ..-nearest neighbour graph. The algorithm is tested on hard practical problems from computational chemistry. These are the problems of semi-empirical many-body potential energ作者: Anonymous 時間: 2025-4-1 13:13
